Mientras estudia en Irlanda, la joven y brillante violinista Finley conoce a la estrella de cine Beckett, que está rodando ahí la última entrega de su exitosa franquicia medieval de fantasía. Un romance inesperado surge entre ambos cuando el rompecorazones Beckett conduce a la inquieta Finley a un despertar aventurero, y ella lo anima a hacerse cargo de su futuro, hasta que la presión de su popularidad se interpone en su camino.

Después de haber sido contaminadas con una misteriosa sustancia química, llamada Ooze, cuatro tortugas que viven en las alcantarillas de Nueva York se transforman y mutan, de repente, en grandes tortugas. Ahora pueden hablar y caminar como un ser humano. Entrenadas por una vieja pero sabia rata (el Maestro Splinter) las cuatro tortugas, Leonardo, Miguel Ángel, Donatello y Rafael, aprenderán técnicas ninja para enfrentarse a los más peligrosos criminales. Sus enemigos son los miembros de una secta llamada "El clan del pie", liderada por Shredder, quien quiere convertirse en el amo del mundo.